Οι διαδικασίες λειτουργίας τόσο για τις μηχανές χάραξης με λέιζερ όσο και για τις μηχανές χάραξης CNC είναι πανομοιότυπες. Ενώ οι μηχανές χάραξης λέιζερ είναι τεχνικά ένας τύπος μηχανής χάραξης CNC, υπάρχουν σημαντικές διαφορές μεταξύ των δύο. Οι κύριες διακρίσεις είναι οι αρχές λειτουργίας, τα δομικά στοιχεία, η απόδοση επεξεργασίας, η ακρίβεια επεξεργασίας και τα συστήματα ψύξης.