Le procedure operative sia per le macchine per incisione laser che per quelle per incisione CNC sono identiche. Sebbene le macchine per incisione laser siano tecnicamente un tipo di macchina per incisione CNC, ci sono differenze significative tra le due. Le principali distinzioni riguardano principi operativi, elementi strutturali, efficienza di lavorazione, precisione di lavorazione e sistemi di raffreddamento.