По долготрајна употреба, индустриските чилери имаат тенденција да акумулираат прашина и нечистотии, што влијае на нивните перформанси за дисипација на топлина и оперативната ефикасност. Затоа, неопходно е редовно чистење на индустриските чилери. Главните методи за чистење на индустриските чилери се чистење на филтерот за прав и кондензаторот, чистење на цевководот на системот за вода и чистење на елементите на филтерот и екранот на филтерот. Редовното чистење помага во одржување на оптималната работна состојба на индустрискиот чилер и ефикасно го продолжува неговиот животен век.