Procedurat operative si për makineritë e gdhendjes me lazer ashtu edhe për makineritë e gdhendjes CNC janë identike. Ndërsa makinat e gdhendjes me lazer janë teknikisht një lloj makine gdhendjeje CNC, ka dallime të rëndësishme midis të dyve. Dallimet kryesore janë parimet e funksionimit, elementët strukturorë, efikasiteti i përpunimit, saktësia e përpunimit dhe sistemet e ftohjes.