Yleisimmät PCB-lasermerkintäkoneet toimivat CO2- ja UV-laserilla. Samoissa kokoonpanoissa UV-lasermerkintäkoneella on suurempi tarkkuus kuin CO2-lasermerkintäkoneella. UV-laserin aallonpituus on noin 355 nm ja useimmat materiaalit voivat absorboida paremmin UV-laservaloa infrapunavalon sijaan.