Vedenjäähdytinyksiköiden ylikuormitussuoja on olennainen turvatoimi. Tärkeimmät menetelmät vedenjäähdyttimien ylikuormituksen hallintaan ovat: kuormituksen tilan tarkistus, moottorin ja kompressorin tarkastus, kylmäaineen tarkastus, toimintaparametrien säätäminen ja yhteydenpito henkilöstöön, kuten jäähdyttimen tehtaan huoltotiimiin.